Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms