Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD2Q6P5Q4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms