Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF40BQ6NWY9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF40BQ6NWY9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms