Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RINT1Q6NUQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RINT1Q6NUQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms