Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
REEP3Q6NUK4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms