Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RNF123Q5XPI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms