Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DENND4CQ5VZ89 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms