Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD4Q5VX71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD4Q5VX71 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms