Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BROXQ5VW32 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BROXQ5VW32 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms