Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH2Q5VUJ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms