Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC18Q5T9S5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms