Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CEP170Q5SW79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms