Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC38Q5R3I4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms