Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5PR19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5PR19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q5PR19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q5PR19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q5PR19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5PR19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5PR19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5PR19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms