Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCID2Q5JVF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCID2Q5JVF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms