Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD3Q5JV73 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms