Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf116Q5BN46 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms