Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGO2Q562F6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms