Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms