Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms