Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP28Q4G0W2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms