Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms