Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P3H1Q32P28 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P3H1Q32P28 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms