Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC27Q2M243 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms