Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
QSER1Q2KHR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
QSER1Q2KHR3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms