Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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