Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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