Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP1Q16831 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms