Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B3Q16720 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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