Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LY6EQ16553 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LY6EQ16553 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms