Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC6Q16204 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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