Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms