Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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