Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP5Q14D33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms