Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN2CQ14957 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2CQ14957 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms