Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX1Q14549 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX1Q14549 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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GBX1Q14549 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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