Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BECN1Q14457 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms