Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A2Q14055 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms