Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGB1Q14028 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
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