Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK13Q14004 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK13Q14004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
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