Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX2Q13950 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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