Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms