Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF4BQ13523 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF4BQ13523 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms