Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SP140Q13342 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP140Q13342 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP140Q13342 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP140Q13342 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP140Q13342 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP140Q13342 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP140Q13342 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP140Q13342 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP140Q13342 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP140Q13342 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SP140Q13342 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP140Q13342 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP140Q13342 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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