Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2BQ13224 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2BQ13224 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
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