Protein–RNA interactions for Protein: Q13118

KLF10, Krueppel-like factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF10Q13118 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF10Q13118 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF10Q13118 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms