Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDNQ13061 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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