Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRJQ12913 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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