Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ZPS1YOL154W 750 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 GCY1YOR120W 939 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YOR282WYOR282W 321 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 DPH2YKL191W 1605 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 PCS60YBR222C 1632 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 VNX1YNL321W 2727 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ORC6YHR118C 1308 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SST2YLR452C 2097 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 NOP12YOL041C 1380 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 HRP1YOL123W 1605 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UBC8YEL012W 657 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 PRM10YJL108C 1152 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YBL010CYBL010C 843 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YNL019CYNL019C 855 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SIW14YNL032W 846 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YNL033WYNL033W 855 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RHO2YNL090W 579 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YOL159CYOL159C 516 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CMR3YPR013C 954 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ROX1YPR065W 1107 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SRB6YBR253W 366 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UBP7YIL156W 3216 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 NMD3YHR170W 1557 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 THI20YOL055C 1656 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 snR5snR5 204 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YDL144CYDL144C 1071 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ATO3YDR384C 828 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YHR130CYHR130C 336 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YJL175WYJL175W 513 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RPS5YJR123W 678 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 HOF1YMR032W 2010 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 PMT5YDL093W 2232 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ENP2YGR145W 2124 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 APM2YHL019C 1818 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 NOP56YLR197W 1515 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YJL049WYJL049W 1353 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CRZ1YNL027W 2037 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 BUD27YFL023W 2391 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 MET32YDR253C 576 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YDR396WYDR396W 501 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ERD1YDR414C 1089 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RMD6YEL072W 696 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SNZ3YFL059W 897 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YIP1YGR172C 747 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YJR020WYJR020W 333 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 FUN19YAL034C 1242 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YKL136WYKL136W 399 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SRP40YKR092C 1221 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 IES3YLR052W 753 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CIN4YMR138W 576 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SNZ2YNL333W 897 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RDL2YOR286W 450 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 SUB2YDL084W 1341 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 AZR1YGR224W 1842 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UTP9YHR196W 1728 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 NGG1YDR176W 2109 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 DUG1YFR044C 1446 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 HSP104YLL026W 2727 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 Q0092Q0092 141 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ZRT2YLR130C 1269 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YMR310CYMR310C 954 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RLP7YNL002C 969 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 PRX1YBL064C 786 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YAF9YNL107W 681 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YNL337WYNL337W 255 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 TRS33YOR115C 807 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RFA1YAR007C 1866 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 MET3YJR010W 1536 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 APE1YKL103C 1545 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 HFD1YMR110C 1599 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 GEX2YKR106W 1848 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ADY4YLR227C 1482 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RRP42YDL111C 798 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CWC21YDR482C 408 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 VMA8YEL051W 771 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ASK1YKL052C 879 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UPS2YLR168C 693 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ARC18YLR370C 537 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 MRPL10YNL284C 969 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UBC11YOR339C 471 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CUR1YPR158W 759 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YBR124WYBR124W 360 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 ASN1YPR145W 1719 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 UTP18YJL069C 1785 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CLA4YNL298W 2529 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 CET1YPL228W 1650 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 DSF1YEL070W 1509 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 RRB1YMR131C 1536 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YNR073CYNR073C 1509 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MAG1YER142C 891 nt5.15□□□□□ -1.59
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