Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CTF8YHR191C 402 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 RFU1YLR073C 603 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YML6YML025C 861 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YML108WYML108W 318 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YAH1YPL252C 519 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 HXT4YHR092C 1731 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 KIN3YAR018C 1308 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 BUD7YOR299W 2241 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SDS23YGL056C 1584 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YMR279CYMR279C 1623 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ALT1YLR089C 1779 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CBP4YGR174C 513 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YAL045CYAL045C 309 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 APM2YHL019C 1818 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 AYT1YLL063C 1425 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 MEC3YLR288C 1425 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 HOF1YMR032W 2010 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 TAH11YJR046W 1815 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 MKK1YOR231W 1527 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 TDA3YHR009C 1572 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YDR327WYDR327W 327 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YER084WYER084W 387 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 PAU5YFL020C 369 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YFL068WYFL068W 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 COX8YLR395C 237 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 PDP3YLR455W 915 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YML133W-BYML133W-B 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ARG80YMR042W 534 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 VBA5YKR105C 1749 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CYC8YBR112C 2901 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YBR241CYBR241C 1467 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 NGL2YMR285C 1548 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 ERO1YML130C 1692 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YCR013CYCR013C 648 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 YRB1YDR002W 606 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SCS2YER120W 735 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CPR2YHR057C 618 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 UNG1YML021C 1080 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SHP1YBL058W 1272 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 SCW10YMR305C 1170 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 CBC2YPL178W 627 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 OPI11YPR044C 354 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BRQ12217 IOC4YMR044W 1428 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HXK2YGL253W 1461 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CTK1YKL139W 1587 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 DPH2YKL191W 1605 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RDR1YOR380W 1641 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 PMT5YDL093W 2232 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 PAM1YDR251W 2493 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 snR80snR80 171 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 MTR3YGR158C 753 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YHL049CYHL049C 816 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 EOS1YNL080C 1101 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YNR005CYNR005C 405 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 PRE10YOR362C 867 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 SPN1YPR133C 1233 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YJR098CYJR098C 1971 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CCZ1YBR131W 2115 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 TIM50YPL063W 1431 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CEX1YOR112W 2286 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HAP4YKL109W 1665 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 HNT1YDL125C 477 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CGR1YGL029W 363 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YGL108CYGL108C 423 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RMR1YGL250W 726 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 YGR265WYGR265W 411 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 RPB3YIL021W 957 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 BXI1YNL305C 894 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 MRM1YOR201C 1239 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 AIM4YBR194W 372 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BRQ12217 CEM1YER061C 1329 nt6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms